Alors que les seconds Examens Chûnins débutent après la désertion de Sasuke à Oto, Naruto s'entraîne avec Jiraya.
Obito cherche à détruire toute l'alliance en utilisant une technique d'enfermement. Pourra-t-elle être sauvée à temps ?
Alors qu'Obito invoque le Tsukuyomi Infini, Jubi, qui prend sa forme ultime, voit ses racines piéger les ninjas et absorber leur chakra.
Les branches de l'arbre Shinju ont aspiré l'énergie physique de Shikamaru et d'une partie de l'alliance ninja. Les cinq Kage arrivent en renfort.
Hashirama invite tous les ninjas à faire équipe et à garder espoir. Naruto, Sasuke et Jûgo continuent de se battre contre Obito.
Face aux difficultés rencontrées par le groupe, Sasuke décide d'unir son Susanô avec le chakra de Kyûbi pour gagner en puissance.
Naruto s'immisce dans les pensées d'Obito pour le convaincre de renoncer à ses ambitions.
Les premières années de l'équipe Minato sont passées en revue.
Kakashi et Minato rejoignent Obito, à présent affaibli. Les démons à queues sont libérés.
Une fois Madara immobilisé, Naruto envoie un Orbe shuriken pour le détruire. Gaara se souvient de l'évolution de sa relation avec Naruto.
Après un entraînement de Hinata, l'Ancien des Hyûga exprime des doutes à Hanabi au sujet des capacités de sa sœur. Hanabi commence alors à s'entraîner dur.
Hanabi veut devenir plus forte pour protéger son clan. Informée par Natsu que sa sœur participera aux examens Chûnin, elle estime que c'est une perte de temps.
Madara profite des difficultés d'Obito et de Hashirama pour renverser la situation et décide d'affronter les démons à queues.
Madara parvient à résister aux démons à queues, aidé du Zetsu blanc. Gaara, Naruto et Killer Bee semblent impuissants.
Madara scelle les démons à queues. Quand Tobirama Senju tente de s'opposer à Madara, Gaara en profite pour emmener Naruto.
Alors que Naruto est parti s'entraîner avec Jiraya pendant 3 ans, Suna propose à Konoha d'organiser l'examen Chûnin ensemble.
Les équipes de différents villages cachés se préparent à l'examen. Shikamaru ayant déjà validé le précédent, Ino propose à Sakura de le remplacer.
Les candidats s'apprêtent à passer la première épreuve. Les camarades de Shikamaru pensent qu'il a organisé un simple test écrit, mais est-ce bien le cas ?
Neji, qui semble avoir trouvé la solution à l'épreuve, a besoin de la collaboration de tous les candidats. Saura-t-il les convaincre de laisser de côté leurs rivalités ?
Parvenus à Suna, les candidats se demandent ce qui les attend dans le Désert du mal.
L'équipe Gaï est en chemin pour chercher des parchemins du ciel et de la terre.
Rock Lee découvre avec surprise qu'il a de nombreux points communs avec Shira. L'avènement de Gaara à Suna aura-t-il changé la donne pour les adeptes du taijutsu ?
Rock Lee et Shira décident de s'affronter dans le seul but de confronter leurs techniques. Qui des deux virtuoses l'emportera ?
L'équipe Kurenaï recherche les parchemins pour passer la seconde épreuve.
Sans rouleau ni aucune piste de l'ennemi, Kiba et ses compagnons commencent à douter. Mais le souvenir de Naruto change la situation.
Dans le Désert du mal, Tenten s'interroge sur ses facultés mais Maître Gaï lui vient en aide.
Tenten échappe à la mort avec une kunoichi dans les décombres souterrains d'un palais en ruine. Sauront-elles mettre leurs différences de côté afin de s'entraider ?